Играчът се премества в Алоа и започва своето приключение с едно от началните покемони (Rowlet, Litten или Popplio), придружаван от професор Кукуи и приятеля си Хау. Вместо лидери на зали, участва в изпитания и големи изпитания на четири острова, с тотем покемони като босове. Отбор Скалата създава хаос, докато Фондация Айтър твърди, че защитава покемоните, но крие тъмни мотиви. Играчът среща Лили и мистериозния покемон Космог, свързан с легендарните Лунала (Луна) и Солгалео (Слънце).
Играта въвежда Z-удари, регионални форми (алоански варианти) и Ултра зверове, като премахва HMs и добавя покемони за каране. Pokémon Moon се развива 12 часа по-късно от Pokémon Sun, влияейки на игровата среда. Отличава се с фокус върху разказа, културното разнообразие и иновациите в структурата на пътуването.