Свети Николай е може би най-красивата църква в Пирея и една от най-старите в новия град Пирея, така както той се е оформил след Революцията за независимост от турците през 1821 г. и основаването на новата гръцка държава след 1930 г.

Църквата принадлежи към категорията на кръстовидните вписани и има три купола, от които два са ниски, а централният е голям елипсовиден, с островно "фенер" на върха му. Външните размери на църквата са 25,85x35,60 м., а на трите й страни, северна, южна и западна, има три еднакви преддверия с размери 10x3,75 м., които излизат пред основната църква. Преддверията са с плоска форма с фалшиви прозорци, покрити с двускатни покриви и елементи. Основният западен фасад има три врати, а двете странични по една.

Преддверията са изградени от солидни мрамори с дванадесет украсени капители в коринтски стил, по четири на всеки вход. Горната част на всеки елемент е покрита с френска керемида, а вътре с 44 изящно рисувани квадратчета в син цвят. На входа има дълго преддверие с плоска покривка, над което вдясно и вляво има два големи помещения на единен женски етаж. Вдясно и вляво на преддверието има две дървени стълбища, по които се качва на женския етаж. Женските етажи са покрити с куполи.

Църквата носи на запад от преддверието две камбани. Те имат основи от два слоя, а на върха си се опират на четири колони всяка, върху които се поддържа мраморната декорация и два малки куполи, които носят кръст. Във всяка отвор между колоните има двойно "прозорец" от мрамор с колонка в средата и декорация с кръст в горната част.

На източната страна на църквата се открояват трите ниши на Светилището. Те са полукръгли, двете малки имат по едно прозорче, докато основната ниша има три прозорца с декоративна солидна мраморна облицовка отвън и многоцветни витражи отвътре. Над двете малки ниши също има големи двойни прозорци, подобно на останалите от двете външни страни. В горната част на църквата от всяка страна има четири еднакви прозорци с мраморна облицовка и корниз на колони от двете страни.

Църквата е изградена от камък върху колони с основи с дебелина от 1,05 до 1,50 м. Освен преддверията, които са изцяло изградени от мрамор, цялата църква и вътрешните колони, на които се опират куполите, са изградени от зидария. Вътрешността на църквата се опира на четири независими колони, върху които с арки и сводове стои надстройката на трите купола, които са изградени от леки материали от малтезитни камъни и специални видове керемиди.

Целият покрив има шест еднакви двускатни покрива (под ъгъл), три малки двускатни отпред и един извит над основната ниша на Светилището. Всички са покрити с френска керемида. Малките куполи имат четири прозорци-светлинки, а основният купол осем. Църквата е обиколена със стенен корниз с декоративни колони, както и на шестте странични на прозорците.

Църквата на открито има на север голямо стълбище, което води до преддверието, както и отпред, преди голямата западна тераса. В миналото на основата на църквата е имало магазини, докато днес в подземното пространство се помещават зали и кухня за социалните и катехизаторските нужди на енорията. От южната страна входът е на нивото на страничната улица.

Църквата, с древногръцките си характеристики на трите преддверия, е уникален бижу на съвременния град Пирея, заедно с околния си площад и парковата зона на сухопътната част на порта, която има голям подземен паркинг.