Линк, сега рицар от Хилия, служи на принцеса Зелда в замъка Хайрул. Когато сянката на Линк отвлича принцеса Зелда, Линк трябва отново да се подготви да победи силите на злото. За да постигне това, той се нуждае от легендарния четворен меч, но неговото придобиване означава, че трябва да освободи и след това да се бори с древната зла сила Ваати. Четворният меч също разделя Линк на четири различни версии на себе си, и тези нови Линкове не са партньори! Спасението на Зелда, победата над Ваати и овладяването на ексцентричните му същности няма да е лесна задача!