Съществуват две реалности: едната се състои от нашия ежедневен живот и едната, която оспорва това, което знаем досега. ПЪРВАТА е СЪН. ДРУГАТА е MATRIX!

Нео, Морфей и Тринити ни "събуждат" в непоносимо реалния и тъмен свят на Матрицата. Мисията на Нео е да спаси Zion, последния свободен град, от армия от 250 000 смъртоносни машини, които заплашват да го унищожат. Ако не успее, човешкият род ще изчезне от лицето на Земята.

Жителите обаче, насърчени от убеждението на Морфей, че пророчеството ще се изпълни и войната с машините ще приключи благодарение на избраника, който е Нео, възлагат всичките си надежди на него. Но Нео е измъчван от ужасяващи кошмари, свързани с живота на любимата му Тринити.