Играта Soul Hackers предлага RPG изживяване от първо лице с приключения в подземия в бъдеще, където технологията и свръхестествените сили се сливат в зловещ съюз на киберпънк футуризъм и готически ужас. Тази епична научно-фантастична RPG история разказва за град, който се счита за маяк на човешкото господство над технологията, но крие дяволска тайна. В тази предполагаема утопия, група хакери поема действия срещу тайно общество, датиращо векове назад, и битка за контрола над съдбата на човечеството е на път.

В класическата традиция на Shin Megami Tensei, играчите имат изкушаващата опция по време на изследване на подземията да се борят срещу демонските врагове, които срещат, или да преговарят с тях, опитвайки се да ги превърнат в съюзници. Тази версия на Soul Hackers за Nintendo 3DS носи японската класика на геймърите с подобрения като 30 допълнителни демона, ново начално видео и тематична песен, подобрени контроли и по-бързи времена за зареждане. Освен това, играчите могат да използват долния екран на 3DS като функция за автоматично картографиране и да активират хак COMP за промяна на нивата на трудност и попълване на карти без необходимостта да ходят.

След като завършат играта, версията за 3DS на Soul Hackers също предлага допълнителен бутон, където играчите ще станат свидетели на появата на Raidou Kuzunoha от предишните игри Devil Summoner.