В близкото бъдеще, колосален и мистериозен обект с неизвестен произход се появява в орбитата на Земята. Поради формата си, светът го нарича Метахедрон. Екипаж от четирима души, наречен S.C.A.R. (Sentient Contact Assessment and Response), пътува с кораба Хермес, за да анализира мистериозния извънземен обект.

Докато се приближават към Метахедрона и започват да го сканират електронно, обектът започва да привлича Хермес към себе си. Екипажът губи контрол над кораба и всичко става бяло. Героинята на играта, Кейт, се събужда на извънземна планета – тя е напълно сама и другите членове на екипажа не се виждат никъде. Докато започва да вижда видения на спектрална фигура, тя открива, че са минали седмици или дори месеци от началото на мисията й. Кейт също така научава, че екипът й е успял да оцелее на планетата. Докато ги търси, тя открива, че лидерът на мисията (Робинсън) е мутирал в ужасно същество, но Тамара и Майк (другите членове) все още са живи, въпреки че Майк изглежда започва да мутира, а Тамара е изчезнала, търсейки начин да му помогне. Така започва мисията за намиране и спасяване на тях.