В Япония, в близкото бъдеще, екипът G.I. JOE е особено развит, но млад по сърце. COBRA е нещо по-зло от всичко, което е било наблюдавано в миналото! Цялата Япония може да бъде опустошена в огнените условия на влечугите, ако JOEs не успеят да спрат COBRA!