Копченето на узрелите чушки Халапеньо е традиционен метод за сушене и съхранение, използван от векове. Техниката е разработена от ацтеките. За копченето се използва дървото на мескитата, което придава на изсушените плодове силен, копчен вкус. Копченото халапеньо е известно като Чипотле.