Тридесет години след като боговете превърнаха Токио в развалини, оцелелите се заемат да отговорят на една на пръв поглед невъзможна задача: как се убива бог?

Япония е била нападната от богове, оставяйки след себе си само смърт и разрушение. С цели градове, класифицирани като необитаеми опасни зони, изследователят срещу богове Сачиюки Токинага е решен да намери начин да свали боговете и да спаси човечеството. Когато случайността го среща с ученичката Вака Камикура, двамата може би ще променят съдбата на света завинаги.

Вака е дала клетва да убие боговете, което прави откритието за бог, живеещ вътре в нея, още по-обезпокоително. Междувременно змийският бог, който е отвлякъл Йорико и е приел формата на нейния годеник Минами, започва да привлича вниманието на другите богове. С всички очи, насочени към него и института, какви нови ужаси ще донесе новото внимание на боговете за човешките изследователи?