Батерията на iPhone 16 е литиево-йонна (Li-ion) с номинален капацитет около 3.561 mAh. Работното ѝ напрежение е 3.85V, а общата енергия, която може да съхрани, възлиза на около 13.7 Wh.
Подобрената енергийна ефективност на процесора A18 и по-доброто управление на захранването позволяват увеличена автономност, с продължителност до 20 часа за възпроизвеждане на видео и до 80 часа за възпроизвеждане на аудио.
Поддържа бързо кабелно зареждане до 20W, както и безжично зареждане MagSafe до 15W, със съвместимост и със стандарта Qi2.