Батерията на iPhone 16 Plus е от литиево-йонен тип (Li-ion) с номинален капацитет 4.674 mAh. Работното ѝ напрежение е около 3.83 V, а общата енергия, която може да съхрани, е приблизително 17.9 Wh. Apple посочва, че комбинираната работа на процесора A18 и управлението на енергията от iOS осигуряват изключителна автономност, с издръжливост до 27 часа при възпроизвеждане на видео и до 100 часа при възпроизвеждане на аудио.
Поддържа бързо кабелно зареждане чрез USB-C 20W и безжично зареждане MagSafe до 25W.