Природните цеолити, главно клиноптилолитът, могат да се използват в земеделието за подобряване на качеството на почвата и увеличаване на добивите, благодарение на своите уникални свойства. Йонообменните свойства на цеолитите могат да бъдат използвани в земеделието поради добрата им абсорбция и високия капацитет за катионен обмен. Природните цеолити са като цяло подходящи за възстановяване на почвата, контрол на ерозията и подобряване на почвените условия в сухи и полусухи среди, особено в почви, бедни на пясък и глина. Освен това цеолитите могат да повишат ефективността на органичните торове.