Батерията на iPhone 13 mini е от тип литиево-йонна (Li-ion) с номинален капацитет 2.438 mAh. Работното ѝ напрежение е 3.83V, а общата енергия, която може да съхрани, е 9.34 Wh.
Въпреки че iPhone 13 mini запазва същия компактен размер като своя предшественик, новият процесор A15 Bionic и по-големият капацитет на батерията осигуряват по-добра автономност, с издръжливост до 17 часа за възпроизвеждане на видео и 55 часа за възпроизвеждане на аудио.
Поддържа бързо кабелно зареждане 20W и безжично зареждане MagSafe 12W.