Правилната поддръжка на слънчевите колектори е необходима за предотвратяване на повреди и за безпроблемната работа на системата. В случай на отсъствие за дълъг период от време, главно през летните месеци, слънчевите колектори трябва да бъдат покривани. Ако това не се направи, събраната вода в бойлера може да достигне високи температури, без да се използва.

Ако не е извършена необходимата поддръжка, съществува риск, свързан със защитните елементи на системата. Ако защитните елементи не се задействат, е възможна повреда на бойлера. През зимата използването на покривало също е важно, особено при ниски температури.